Sequencher DNA序列分析軟件是科學家們必備的工具。持續(xù)發(fā)展和改進超過25年，Sequencher提供了無與倫比的功能特征，成千上萬的出版物都有相關的應用介紹。新手用戶可以以最少的時間投資產(chǎn)生結果，而有經(jīng)驗的用戶會驚嘆于功能的深度和控制。Sequencher自帶各種專有算法，可以為Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列數(shù)據(jù)生成結果。

Sequencher 5.4.6新功能

為DNA序列分析提供了全新的和增強的功能。

Sanger

• Sequencher Connections中運行的 Primer-BLAST發(fā)送引物序列到您的Sequencher項目中。

• 在項目窗口中輕松使用一致性序列，作為NGS測序比對混合的參考序列。

• 新批量處理恢復結束命令。

• 在項目窗口中調(diào)整字體大小的功能。

NGS

• GSNAP和BWA-MEM工作流更快。

• 構建GSNAP數(shù)據(jù)庫和BWA索引，這些索引可以被重新用于與整個基因組的對齊。

• 查看并保存用FastQC報告的NGS原始數(shù)據(jù)文件的質(zhì)量分數(shù)和元數(shù)據(jù)。

• 使用SAMtools在您的NGS校準中標記變量來生成不同的調(diào)用文件(VCF)。

RNA-Seq

•  隨著Cuffquant和Cuffnorm的添加，擴展了Cufflinks套件的功能。

• Cuffdiff和 Cuffnorm的Conditions and Replicates編輯器。

• 使用自定義排序和篩選選項來增強RNA-Seq可視化功能。

• 使用增強的外部數(shù)據(jù)瀏覽器輕松管理所有的DNA-Seq和RNA-Seq項目。

Sanger序列

Sequencher使傳統(tǒng)的序列裝配變得容易，同時又能讓您保持對序列的控制。精簡數(shù)據(jù)質(zhì)量差的序列。您甚至可以創(chuàng)建一個整潔的標準庫，讓一切變得更簡單。通過直觀的控制，您可以為數(shù)據(jù)選擇算法，包括匯編到參考中。如果您正在處理來自不同來源的多個示例，可以通過名稱來對它們進行自動裝配。使用工具編輯數(shù)據(jù)從來沒有如此簡單過，幫助您定位和處理模棱兩可的問題，還可以檢查雜合子并移動您的數(shù)據(jù)。使用信任值幫助修整數(shù)據(jù)、質(zhì)量檢查和SNP檢測，以提高數(shù)據(jù)結果的質(zhì)量。