無菌室應(yīng)根據(jù)既經(jīng)濟又科學的原則來設(shè)置。其基本要求有以下幾點：
（1）無菌室應(yīng)有內(nèi)、外兩間，內(nèi)間是無菌室，外間是緩沖室。房間容積不宜過大，以便于空氣滅菌。內(nèi)間面積2×2.5＝5m2，外間面積1×2＝2m2，高以2.5m以下為宜，都應(yīng)有天花板。
（2）內(nèi)間應(yīng)當設(shè)拉門，以減少空氣的波動，門應(yīng)設(shè)在離工作臺最遠的位置上；外間的門**也用拉門，要設(shè)在距內(nèi)間最遠的位置上。
（3）在分隔內(nèi)間與外間的墻壁或“隔扇”上，應(yīng)開一個小窗，作接種過程中必要的內(nèi)外傳遞物品的通道，以減少人員進出內(nèi)間的次數(shù)，降低污染程度。小窗寬60cm、高40cm、厚30cm，內(nèi)外都掛對拉的窗扇。
（4）無菌室容積小而嚴密，使用一段時間后，室內(nèi)溫度很高，故應(yīng)設(shè)置通氣窗。通氣窗應(yīng)設(shè)在內(nèi)室進門處的頂棚上（即離工作臺最遠的位置），**為雙層結(jié)構(gòu)，外層為百葉窗，內(nèi)層可用抽板式窗扇。通氣窗可在內(nèi)室使用后、滅菌前開啟，以流通空氣。有條件可安裝恒溫恒濕機。
無菌室內(nèi)設(shè)備和用具
（1）無菌室內(nèi)的工作臺，不論是什么材質(zhì)、用途的，都要求表面光滑和臺面水平。
（2）在內(nèi)室和外室各安裝一個紫外燈（多為30W）。內(nèi)室的紫外線燈應(yīng)安裝在經(jīng)常工作的座位正上方，離地面2m，外室的紫外線燈可安裝在外室中央。
（3）外室應(yīng)有專用的工作服、鞋、帽、口罩、盛有來蘇兒水的瓷盆和毛巾、手持噴霧器和5%石炭酸溶液等。
（4）內(nèi)室應(yīng)有酒精燈、常用接種工具、不銹鋼制的刀、剪、鑷子、70%的酒精棉球、工業(yè)酒精、載玻璃片、特種蠟筆、記錄本、鉛筆、標簽紙、膠水、廢物筐等。
