正常的檸檬酸發(fā)酵培養(yǎng)基中除發(fā)酵菌株黑曲霉外粘染其他微生物，稱為染菌。

檸檬酸發(fā)酵染菌原因：

檸檬酸發(fā)酵過(guò)程中由于培養(yǎng)基的特性和通風(fēng)培養(yǎng)，發(fā)酵液容易起泡，嚴(yán)重時(shí)會(huì)出現(xiàn)漫罐，尤其在黑曲霉生長(zhǎng)的對(duì)數(shù)期，黑曲霉代謝旺盛， 一般每隔幾分鐘就要加一次消泡劑。消泡劑需要在發(fā)酵培養(yǎng)過(guò)程中加入，因此消泡劑和相關(guān)的管道如果滅菌不徹底，很容易造成發(fā)酵染菌。

檸檬酸為好氧發(fā)酵，發(fā)酵過(guò)程中需要持續(xù)通風(fēng)，保證發(fā)酵液中的溶氧能夠滿足黑曲霉生長(zhǎng)需要。因此壓縮空氣需要經(jīng)過(guò)過(guò)濾除菌后通入發(fā)酵罐，過(guò)濾器安裝使用不當(dāng)或使用前滅菌不徹底都會(huì)造成發(fā)酵染菌。

檸檬酸發(fā)酵過(guò)程中產(chǎn)生大量的熱量，發(fā)酵罐一般采用內(nèi)置盤(pán)管，使用循環(huán)水進(jìn)行發(fā)酵溫度控制， 由于消罐產(chǎn)生振動(dòng)，在使用過(guò)程中，循環(huán)水的盤(pán)管焊縫會(huì)出現(xiàn)開(kāi)焊或滲漏，造成循環(huán)水進(jìn)入發(fā)酵液， 進(jìn)而污染發(fā)酵液，造成發(fā)酵染菌。

另外檸檬酸發(fā)酵采用培養(yǎng)基實(shí)消，培養(yǎng)基中的蛋白質(zhì)等有機(jī)物在受熱條件下容易變性結(jié)垢，而且發(fā)酵罐內(nèi)盤(pán)管、攪拌、檢測(cè)探頭等部件較多，結(jié)垢容易附著在這些部件上，如果不能及時(shí)清理，結(jié)垢會(huì)滋生雜菌，且結(jié)垢包夾可能導(dǎo)致蒸汽加熱滅菌不徹底，造成發(fā)酵染菌。

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